腦干梗塞早期很難根治，如果超早期達到溶栓的適應癥，可以進行溶栓，如果效果好，可以溶解血管中的血栓，讓血管重新開放，不會留下較大的后遺癥。
但對于梗死面積大，血管動脈硬化嚴重，不穩定斑塊破裂的病人，即使提前進行溶栓，一般也會留下一些后遺癥，比如吞咽困難，肢體活動不良，麻木，偏癱，語言遲鈍，飲水嗆咳等等。

腦干梗死嚴重。會累及到患者的意識，容易出現呼吸、心臟驟停甚至可危及到患者的生命。但并不是所有的腦干梗死都是非常嚴重的，腦干梗死的嚴重程度與否，與患者腦干梗死的部位、腦干梗死的面積都有密切的關系，比如延髓背外側的梗死，容易有猝死的風險。

可能會有頭暈目眩、耳鳴耳聾、視物模糊、惡心嘔吐、血壓升高、口眼歪斜、面部麻木、吞咽困難、意識障礙、走路不穩、共濟失調、復視、偏癱、四肢癱等癥狀，不同的人可能出現的癥狀不同。

腦干梗塞是指腦干梗死，臨床上并沒有確切的定義，腦干梗死發生后5-7天是最危險的。
腦干是中樞神經系統的主干，腦干梗死后會出現頭暈、說話含糊、肢體偏癱、吞咽困難等癥狀，嚴重的還會出現昏迷、應激性潰瘍、呼吸衰竭等。腦干梗死后，還會有腦細胞水腫、顱內壓升高、腦疝等癥狀，從而使病情惡化，嚴重的有生命危險。發病后5-7天是腦干梗塞的高峰期，因此有一定的危險性。

腦干梗塞重度昏迷可能會導致嚴重的后果，使病人出現呼吸衰竭而死、意識不強等。需要立即送到ICU進行嚴密的監護和維持，并對其進行氣管切開、氣管插管、呼吸機輔助呼吸。在藥物方面，可加強脫水，降低腦內壓力，減輕腦干水腫。對符合要求的患者行消融栓塞，無溶栓的患者行微循環、促進側支循環、抗血小板聚集等措施。可以口服納洛酮、醒腦寧等藥物，如果出現高燒，可以使用冰帽進行物理治療。對多種復雜的疾病進行治療，保持器官的正常運作。

腦干梗塞比較嚴重,比其他部位梗塞的危險更大。腦干是人體的生命中樞,有呼吸、心跳中樞。一旦腦干梗塞的發生面積比較大,容易導致患者出現腦干水腫,進而形成腦疝,導致患者的延髓被壓迫,容易形成呼吸、心跳驟停,危害到患者的生命。患者應該盡早前往醫院，在專業醫生的指導下進行治療。在生活當中也應當注意，不要過度的情緒激動，不要吃熱性的食物，多吃蔬菜水果。