化膿性腦膜炎的后遺癥有影響腦實質、反復出現癲癇、智力下降等。
腦膜炎是指軟腦膜的彌漫性炎癥性改變，由細菌、病毒、真菌、螺旋體、原蟲、立克次體、腫瘤與白血病等各種生物性致病因子侵犯軟腦膜和脊髓膜引起，主要包括細菌性腦膜炎、化膿性腦膜炎等，而如果是化膿性腦膜炎，可能會出現影響腦實質、反復出現癲癇、智力下降等后遺癥。

如果能夠早期診斷，正規治療，絕大部分都是能夠臨床治愈的。有一部分未能夠做到早期診斷和規范的治療，預后可能比較差。有可能會出現一些嚴重的并發癥或者后遺癥。

新生兒化膿性腦膜炎是否能治好，關鍵的是看孩子的反應。
兒童年齡過輕，臨床上一般都會有一些不典型的癥狀，一般都是正常的，或是沒有發燒，或是沒有發燒，也沒有明顯的異常。主要癥狀有肌張力降低、少吃少動、拒食嘔吐、吸吮力差、哭聲微弱、黃疸、發干、呼吸不規則等。有些兒童還會出現腦膜刺激征，有些兒童前突凸出時間較長，因此早期才被察覺。一旦被確診，就會出現嚴重的癥狀，抵抗力差，病情很容易惡化，即使有一些可以治愈的，死亡率也會很高。

細菌性化膿性腦膜炎是有生命危險的疾病，應立即治療。癥狀出現就應馬上去急診。細菌性腦膜炎的治療主要是根據腦脊液涂片和培養找到細菌，根據藥物敏感試驗選擇有效的抗生素，及時治療，爭取減少后遺癥的發生。還要對癥處理高熱，控制抽搐，減低顱內壓，減輕腦水腫，還要使用激素減少顱內炎癥粘連。

化膿性腦膜炎如果治療順利，可能不留后遺癥。化膿性腦膜炎，輕的可以治療好。化膿性腦炎容易加重，而且容易出現后遺癥，可能會出現肢體活動的異常，后期需要康復鍛煉治療。化膿性腦膜炎留后遺癥的風險比較小，但還是要定期去醫院復診。

如果治療不及時，或者治療不得當，可留有失聽、失明、癲癇、腦積水、智力和（或）運動障礙等后遺癥。新生兒化膿性腦膜炎是指化膿細菌引起的腦膜炎癥，是常見的危及新生兒生命的疾病，本病常為敗血癥的一部分或繼發于敗血癥，一般新生兒敗血癥中約四分之一會并發化膿性腦膜炎。早期診斷、及時正確的治療是成功的關鍵。如能及時診斷，盡早得到正確治療，新生兒化膿性腦膜炎可以治好。