妊娠期間甲減對孕婦的作用與甲減的嚴重程度有關，遺傳的甲減會對胎兒的發育造成一定的不良反應，從而造成胎兒的生長發育滯后，甚至有可能造成流產的危險。
亞臨床甲減是不是引起懷孕的原因，目前還沒有定論，但在懷孕初期出現甲減，特別是臨床性甲減，會對胎兒的長期智能產生一定的負面作用。總之，妊娠期間甲減對胎兒的影響，與懷孕期間的甲減有很大關系。

孕婦甲減可以導致胎兒甲狀腺發育缺陷，也可造成胎兒死亡，最主要的是造成胎兒甲狀腺激素減少。甲狀腺激素是維持機體正常生長發育不可缺少的激素，胎兒的甲狀腺功能在妊娠第12周開始建立，妊娠前半期胎兒大腦發育所需要的甲狀腺激素完全或主要來自母體，孕婦的甲狀腺素特別是對胎兒的腦的發育尤為重要。

妊娠期臨床甲減可增加不良妊娠結局的風險，如早產、流產、胎盤早剝、低體重兒等，同時，還可影響寶寶的智力發育、神經反應能力及運動能力等。所以懷孕前應治療甲減，將對胎兒產生的影響減到最低。

孕婦甲狀腺功能減退時，可使胎兒中樞神經系統發育障礙，造成智力下降、畸形或早產。因此，為了避免這些不良情況發生，應該加強對甲狀腺疾病的重視程度，積極做好相關預防工作。備孕時懷孕時均需要甲狀腺功能檢查，有甲狀腺功能減退者一旦發生，那就應該及時補充甲狀腺激素了，使甲狀腺功能處于正常的偏上狀態，不與藥物一味抵觸，以免延誤治療，影響胎兒發育。

孕婦甲減會對胎兒先天性發育障礙。
甲減會影響寶寶的智力發育、神經反應能力及運動能力等。這是因為甲狀腺是人體重要的內分泌器官，其分泌的甲狀腺素參與身體的生長發育和各器官系統的代謝調節，其中，也是胎兒腦神經發育所必須的激素。所以孕婦的甲狀腺功能對于胎兒的生長發育影響比較大，因此孕期需要檢查甲狀腺功能，判斷是否在正常范圍以內。

孕婦甲減對胎兒影響可以造成胎兒甲狀腺激素的減少，特別是對胎兒和新生兒腦的發育尤為重要。嚴重的甲狀腺激素缺乏會造成胎兒的大腦發育障礙，嬰兒出生后生長緩慢，稱為呆小癥。