外陰部檢查查看陰道黏膜表面是否光滑，質地是否正常，有無出血點，陰道分泌物的性狀及氣味是否正常。白帶常規檢查是否有婦科疾病，如患有性傳播疾病，先徹底治療，然后再懷孕，否則會引起流產，早產等危險。宮頸檢查確定女性是否患有宮頸炎癥，宮頸糜爛和贅生物等，子宮及附件檢查查看女性是否會患有子宮肌瘤，卵巢腫瘤，子宮內膜異位癥，盆腔炎等婦科疾病。

生殖科由男性生殖和女性生殖兩部分組成。
男性生殖科既可對男性進行性功能檢查，也可對精液進行檢測，以了解有無男性不育的情況。
女性的檢查項目就比較多，包括輸卵管情況檢查、卵巢功能檢查排卵檢查等，并對綜合因素進行考察。
不孕癥的發生受到多種因素的制約，因此，在生殖科應進行細致的檢查，明確不孕的原因。

生殖系統腫瘤檢查主要有CT及核磁共振成像，B超，血液學檢查，宮頸涂片檢查，內窺鏡檢查，陰道鏡檢查，活組織病理檢查，通過不同的方法，可以對這些物質進行檢測，從而協助診斷腫瘤。

一般來說，生殖器檢查包括外觀、睪丸、陰囊等部位，可以檢查包括生殖器的發育情況，檢查有無生殖器畸形，有無炎癥，睪丸的位置，陰囊內有無精索靜脈曲張，精索和睪丸鞘膜積液，腹股溝疝等癥狀出現。
此外，生殖器檢查還包括外觀檢查，尿常規檢查，血常規檢查，前列腺液檢查，彩超檢查，精液常規檢查等。如果患者出現不良癥狀，應該及時的前往醫院就診治療，以免耽誤病情。

由于人群不同，生殖系統感染做的檢查也不同。
在女性中，主要是做白帶檢查、婦科超聲檢查、宮頸刮片等三項檢查。若女性陰道內有大量的白帶和分泌物，可直接使用顯微鏡檢查，觀察是否有細菌和真菌。檢查子宮、附件及盆腔積液時，可用于婦科彩超檢查，男性則做精液檢查。

生殖道感染一般需要進行實驗室檢查或者影像學檢查來確診。
如果有泌尿系統感染，男性可以做尿常規和尿培養。如果是精囊炎，可以做核磁共振，如果是前列腺炎，可以做肛門指診，或者是按摩前列腺，做前列腺液檢測。女性可以做白帶、婦科彩超、宮頸刮片等檢查。