會因長期淋漓不盡的出血，而導致宮內感染的危險。藥流如果不徹底，可以引起腹痛，陰道流血，月經不調等癥狀，藥流沒流干凈會導致再次懷孕，還得做第二次人流，對身體造成的傷害也很大，遺留在子宮內會造成感染、大出血、不孕等嚴重的后果，嚴重威脅生殖器健康。會導致宮內感染、盆腔炎、附件炎、輸卵管炎合并堵塞、不孕不育等。建議在藥流后10天左右，去醫院，根據B超檢查情況而決定處理方式，如果殘留物比較小的話，可以不用清宮處理，給予口服生化顆粒。

會對身體有很大程度的損傷，病癥會反復的發作難以控制，不清宮的話，下體長期出血也會引起陰道等部分感染，這樣會增加患者的生病概率，嚴重可導致不孕。藥流不干凈很容易引起眾多感染的病癥，陰道感染或者出現宮腔內感染，甚至會出現不孕不育的情況，會帶來很多的婦科疾病，可能會導致宮腔感染，而且還可能會引起宮腔殘留，還會影響正常排卵，內分泌不調，而且畢竟是死血，會有惡臭，細菌也會趁隙繁殖，感染到卵巢輸卵管，就有可能會導致不孕。同時還可能會導致凝血障礙而引起大出血，嚴重的時候甚至會導致堵塞子宮，出現不孕不育的情況。手術后注意休息至少2周，避免劇烈運動，保持心情舒暢，情緒不宜過于激動，多喝水，不能吃涼的、辛辣刺激性食物，保持外陰部的清潔，每天可以用清水清洗，服用抗菌藥物。

藥流后是否需要清宮需要根據個人的情況來定。如果是服藥后見到有孕囊排出，之后流血不多少于月經量也可以暫時觀察不用清宮，但一周后，一定要去醫院做一個超聲檢查，明確宮腔內是否有胎物殘留。

藥流不干凈后清宮是會疼痛的：
無論是人工流產的刮宮還是藥流的清宮都是挺疼的，因為要用負壓吸宮去吸子宮腔里的東西，但現在有無痛技術，當藥流流不干凈而做清宮時，也可以在靜脈全麻下做清宮，這樣能減少疼痛。
日常生活中，建議清宮后的女性注意保暖，不要吹冷風、碰涼水，并且注意保持外陰部清潔衛生，每天用溫開水清洗1-2次以防止感染。

如果確認是沒流干凈，就必須及時進行清宮手術，如果不清宮會得嚴重的婦科炎癥，對以后生寶寶也是有很大影響。藥流會有失敗的風險，當藥流不干凈，就必須進行二次進行清宮，否則會導致宮內感染，盆腔炎，附件炎，輸卵管炎合并堵塞，不孕不育等，甚至引起大出血危險生命。建議到正規醫院做藥流，休息1-2周，避免干重體力活和冷水作業，以免身體抵抗力降低而誘發其他疾病。同時還要加強營養，多吃高蛋白及補氣血的食物，有利于術后身體的恢復。

還要在家休息14天左右，清宮術即刮宮，清宮術是早期人工流產最常采用的方法。清宮術雖然不用開刀，但也是一種婦科手術，一定要嚴密消毒的情況下進行。平時要注意個人衛生，禁盆浴及性生活一個月，清淡飲食及合理營養。