新生兒一般在出生就可以吃益生菌，建議在進食后一小時左右吃。
如果新生兒存在有早產、喂養不耐受、新生兒黃疸、出現腹瀉、便秘、腹脹等消化道癥狀，或有過敏等情況，都是可以適量服用益生菌的。其需要在醫生指導下使用，以免導致新生兒出現不適癥狀。健康新生兒一般不用補充益生菌。益生菌是對機體的健康產生有益作用的活性微生物，但是過多補充益生菌也可能會導致小孩出現有益菌群過多。

新生兒益生菌在寶寶出現腸胃消化不良，積食腹脹或者腹瀉，便秘的時候吃比較好。如果本身寶寶大便正常，腸胃消化功能也沒有任何問題的情況下，并不需要去吃益生菌，因為使用益生菌也并不是完全無害的。

新生兒益生菌在寶寶出現腸胃消化不良，積食腹脹或者腹瀉，便秘的時候吃最好。如果本身寶寶大便正常，腸胃消化功能也沒有任何問題的情況下，并不需要去吃益生菌，因為使用益生菌也并不是完全無害的，如果長期使用益生菌，在停藥后缺乏外界藥物的補充有可能會導致腸道菌群失調，容易影響正常的腸胃功能。所以通常只有在腸胃有消化問題的時候才需要使用。

一般情況下，由于個體差異，兒童益生菌什么時候吃最好的說法不恰當，家長可以在兒童大便比較干燥或者便秘的時候，給兒童吃益生菌。具體內容如下：
兒童并不是一定要吃益生菌的，如果孩子出生以后以及在發育期間，飲食和大便各方面都是正常的，通常不需要給孩子服用益生菌。但如果兒童大便比較干燥或者存在便秘的情況，則可以給兒童服用益生菌進行調理。

益生菌通常空腹或跟著飯一起吃，這樣的效果是好的，益生菌通常主要治療小兒的腹瀉，包括消化不良、腸炎或痢疾等，有助于寶寶建立正常的腸道菌群，恢復寶寶的消化功能。沖調益生菌的水不能超過37度，溫度過高會把益生菌里的活菌劑給殺死，那么就沒有效果了。

成人益生菌選擇在飯后半小時服用，有利于食物消化與吸收。大多數益生菌是不耐胃酸的。益生菌可抑制有害菌在腸內繁殖，減少毒素和有害物質粘附，促進腸道蠕動，平衡菌群。還可以提高機體免疫力和抵抗力，沖調益生菌不要選擇用開水，用37度以下溫水，以免益生菌活性失效。需要減少益生菌在空氣中的暴露時間，注意避光保存。