一般情況下，小兒慢性腹瀉的治療方法有以下幾種：
1、中醫學：中醫上常把小兒長期痢疾歸因于脾虛、濕熱、寒、傷食等，要結合辨證論治，有針對性的進行相應的處理。脾虛可以服用人參白術散，有痰的可以服用葛根芩連湯，有感冒的可以服用藿香正氣散，有傷的可以服用保和丹，建議患者在醫生的指導下使用藥物進行治療，以免對身體造成不良影響。
2、針灸按摩：可選擇在腹部或肢體部位進行針灸或按摩，可在按摩后進行相應的按摩，從而減輕和改善慢性腹瀉的情況，建議在正規的醫生手法下進行針灸，才能達到較好的治療效果。

小兒慢性腹瀉需要及時就醫檢查，明確具體情況后及時對癥治療，還要注意日常護理。
首先要做一次糞便的檢測。主要看是不是因為腸胃不好或者是因為胃病。出現消化不良時，可以服用一些抗炎癥的藥物，病情較重，需要進行靜脈注射。多飲水，多吃些容易消化的食物。日常生活中要保持良好的個人清潔，要經常洗手，不要食用辛辣和油膩的食品。

小兒慢性腹瀉是病程持續2個月以上的連續腹瀉。
持續腹瀉病程超過兩個月考慮小兒慢性腹瀉。臨床上常見反復發作性腹瀉及大便次數增多。慢性腹瀉是由多種因素所致。感染、營養物質過敏、免疫缺陷、藥物因素等，先天性的變形，急性腹瀉沒有得到徹底的處理或者處理不當，等，多見于兒童人工喂養及營養不良者。其病因主要是腸外營養不足或不能滿足機體對各種營養素需要所致。慢性腹瀉的治療應重視腸道菌群失調的問題和飲食方面的問題。

小兒慢性腹瀉在日常生活中經常能夠碰到。從中醫來說，小兒慢性腹瀉包括中藥內服、推拿和針灸的治療方法。從內科的角度來說，小兒慢性腹瀉很多是脾虛、濕熱、外寒、傷食引起的。因此根據辨證論治的原理，外感寒證的小兒腹瀉，主要表現是糞質清稀、胃口不好，甚至有惡寒、發熱的癥狀，們一般采用外散風寒。

慢性腹瀉常見癥狀：慢性腹瀉是一種典型的慢性病癥，病程長，大便的次數多，每天排便次數一般大于三次，便稀或便不成形，有時伴黏液、膿血。由于長期腹瀉導致腹部不適感嚴重，尤其在餐后或者便前，不適感明顯。結腸疾病引起的腹瀉：結腸疾病導致的慢性腹瀉有，會感到腹部不適，便后不適感緩解或減輕，排便次數多且急，糞便量少，常含有血及黏液。

母乳性腹瀉是一種常見的疾病，如果出現了腹瀉，首先要排除疾病，一般不適慢性腹瀉。
母乳型腹瀉的特征很明顯，一天三到七次大便，大便是一種泡沫稀水樣的，有一股特別的酸臭味，便便淡綠色，有泡沫，有時還會有一條半透明的粘稠液體。腹瀉的時候沒有發燒，沒有明顯的疼痛，也沒有明顯的哭鬧，沒有任何的感染，沒有任何的癥狀，但是寶寶的精神狀態很好，胃口也很好。
但如果腹瀉的時間過長就比較嚴重，可能會導致生長停滯、營養不良等。