甲亢反復發作需要在醫生的指導下進行第二次治療，具體的治療方法要根據復發的原因而定。甲亢復發與用藥不規律有關，如果經常自行停用，可以在醫生的指導下再次服用抗甲狀腺藥物，但要定期復查，并在醫生的指導下調整用藥劑量。
此外，甲亢的復發是因為甲狀腺體積太大，所以很難控制，一般在醫生的指導下，在排除了禁忌后，可以使用碘-131進行治療。放射碘-131可以通過輻射，破壞甲狀腺濾泡上皮，從而導致甲狀腺逐漸纖維化，從而減少甲亢的復發。還有一些甲亢病人會因為甲狀腺體積過大而反復發作。

服藥期間要定期復查才行的，服藥的同時看看效果與療效的，所以必須要堅持服藥定期復查。甲亢這種病要治療比較長的，一般要治療二年半之久才可以慢慢的恢復的，要不然會反反復復復發的，一旦復發又得重新治療。

一般情況下，甲亢的患者，經口服藥物治療甲亢的中斷藥物后兩年復發率能達到50%以上，所以口服藥物治療甲亢癥狀控制、生化指標正常后，需要小劑量抗甲狀腺藥物維持較長時間，甚至2年以上。
對于這種反反復復發作的病人，藥物治療效果不佳時，一般建議手術治療或者碘131治療，同時患者還要保持良好的心態，不要過于焦慮、恐懼，要注意休息，適當運動，都有助于病情的恢復。

可以適當的吃含碘的食物，以保證胎兒碘的需要量。如果血常規和肝功能正常，可以口服抗甲狀腺的藥物，根據甲狀腺的功能決定藥量。每個月到內分泌門診復查甲狀腺功能，適當的調整藥量。

一般甲亢對孕婦和胎兒有好多的不良影響，但妊娠期的甲亢治療不能用放射性碘治療，也不主張手術治療，但是藥物過敏的，又有藥物禁忌癥的，可在懷孕的4-6個月手術治療。如果病人癥狀輕微，T3、T4輕微增高的，可以密切觀察。如果需要用抗甲狀腺的藥物。

懷孕期間甲亢主要檢查是否存在妊娠甲亢綜合癥，孕婦甲亢綜合癥一般不屬于甲亢，但出現了甲狀腺中毒的現象。
一般出現在懷孕8-12周，15周后出現，這種情況會慢慢緩解，或者消失。如果這時候對患者體內的促甲狀腺激素受體抗體進行了優化，在懷孕期間沒有出現妊娠期甲亢綜合癥，檢測結果為（+)，同時還檢測到了（+)，同時還檢測到了甲狀腺的血流信號。