通常情況下，小兒腦炎后遺癥有肢體癱瘓、癲癇、智力低下等。具體情況分析如下：
兒童腦炎有兩種情況，一種是化膿性腦炎，另一種是病毒性腦炎。化膿性腦炎的并發癥有硬膜下積液，癥狀為化膿性腦膜炎，在治療期間體溫不升高，病程中前囟門進行性充盈；腦室管膜炎，主要表現為高燒不退，頻繁抽搐，甚至是呼吸衰竭；腦積水、前囟門增大、頭圍逐漸增大、頭皮靜脈擴張等。病毒性腦炎一般在1-2個星期內痊愈，嚴重時會出現肢體癱瘓、癲癇、智力低下、失語、失明等后遺癥。
另外，單純皰疹病毒腦炎、乙型腦炎、腸病毒71腦炎的死亡率也較高。

一般來說，腦膜腦炎后遺癥如下：
第一，出現失語、說話吐字不清等語言協調功能問題，難以正常交流。
第二，偏癱、無法正常行走。
第三，癡呆、記憶力下降、認知水平降低。
第四，患者變得易怒，情緒波動大。
日常生活中，患者應注意多休息，避免過度勞累，保持心態平和，不要有太大的精神壓力，還要注意個人飲食，多吃新鮮的蔬菜和水果，保證營養均衡，有利于身體恢復。

腦炎的后遺癥主要有：1、腦炎累及人體運動神經，引發運動功能障礙，導致四肢無力、活動能力受限的后遺癥；2、腦炎發病部位本來就屬于大腦，因此更容易損害大腦神經引發智力障礙；3、疾病累及語言神經，引發失語后遺癥；4、眼球麻痹也是腦炎的后遺癥之一，由于這種疾病也容易讓視覺神經受損；5、腦炎也容易引發肌肉萎縮的后遺癥。

兒童腦炎后遺癥癥狀多為一側上肢癱瘓或雙上肢癱瘓。意識障礙，甚至去皮質狀態等不同程度意識改變，顱壓增高癥狀，多數可完全恢復，但少數遺留癲癇、肢體癱瘓、智能發育遲緩等。

腦炎的后遺癥可謂是非常多的因為腦炎是腦組織廣泛性損害所以如果不積極治療或者治療不及時不妥當的情況下可能會遺留很多后遺癥比如癲癇發作智能減退語言發育遲緩運動發育遲緩腦癱也可以出現偏身運動障礙偏身感覺障礙失語構音障礙尿便失禁嚴重時會危及生命。出現植物狀態得腦炎后及時就診神經內科請醫生分型后對癥治療。

腦膜炎如果治療不及時或不徹底，部分病人會出現智力減退，另一部分病人可能會出現失明聽力減退，可間接的影響病人智力發育，所以需要積極的預防。腦膜炎通常可以完全復原，少數的病人可能會出現一些腦部傷害，因而導致耳聾、癲癇或功能障礙，特別是未能對此病及時加以治療更會如此。