治療做頸椎x片，多普勒超聲檢查，腦干聽覺誘發電位等。急性發作期治療一般以靜脈注射藥物為主，減少口服的藥物。基底動脈供血不足，便會出現復雜的臨床癥狀，且受損部位程度，側支循環等情況都有不同的差異。

一般情況下，基底動脈閉塞腦干梗死，通常是大范圍的腦干梗死。這種情況比較嚴重，可能會有肢體癱瘓、精神障礙等情況，會導致呼吸、血壓、心跳、血氧飽和度降低。需要進行心臟監測，如果病人有不穩定的情況，可以使用呼吸機。在出現嚴重的精神癥狀時，可以給予醒腦寧、安宮牛黃丸、復方麝香等藥物。
在病情平穩后盡快進行康復訓練，主要有吞咽、四肢功能、針刺等。平時多注意低脂低鹽清淡飲食，促進血液循環、末梢神經功能恢復。

心供血不足即心肌缺血。心肌缺血、腦供血不足可以通過藥物、手術等方式進行治療。
1.藥物：硝酸酯類藥物能擴張冠狀動脈，增加心肌供血，如單硝酸異山梨酯。溶栓藥物能溶解急性形成的血栓，用于急性心肌梗死。
2.手術：冠狀動脈介入治療具有創傷小、恢復快、住院時間短的特點，廣為患者接受。所以對于癥狀發作典型或不穩定、藥物治療不理想、無創檢查提示心肌缺血的患者建議行冠脈造影檢查，必要時行支架置入術。

注意保護頸椎，避免長時間的低頭伏案工作和閱讀，這樣的動作可以使頸椎充分的放松，還可以進行自我按摩后頸部的肌肉。后頸部的肌肉也應該注意防寒保暖，不應該受涼。另外，可以吃些活血化瘀的藥物，能夠促進血液循環，改善微循環，從而增加大腦的供血以及供氧。

必須注意保護頸椎，避免長時間的低頭伏案工作和閱讀，這樣的動作可以使頸椎充分的放松，還可以進行自我按摩后頸部的肌肉。后頸部的肌肉也應該注意防寒保暖，不應該受涼。另外，可以吃些活血化瘀的藥物。

在治療腦功能不全時，局部腦血管擴張應增加分支，有效供應腦組織細胞的血氧合，直接改善大細胞缺血缺氧現象。物理和中醫常用于臨床治療。同時，對病人進行日常康復訓練，如生活規律、定期生活、定期服藥、低鹽低脂飲食、不吸煙、不飲酒、適當鍛煉和工作、注意休息和睡眠等。