口腔潰瘍的治療以消除病因、增強體質、對癥治療為主，治療方法應堅持全身治療和局部治療相結合，中西醫治療相結合，生理和心理治療相結合。口腔潰瘍常呈周期性發作，復發時間長短與口腔潰瘍病史長短有密切關系。
出現口腔潰瘍等引起來的不適一般和維生素的缺乏免疫力下降，以及近段時間口腔過銳的牙齒殘根不良刺激物的刺激等都有一定的關系。這段時間注意多休息，不要熬夜，少吃辛辣刺激性的食物，多吃些新鮮的瓜果蔬菜，盡早及時的治療牙齦炎和齲齒，有時間還是多到戶外活動，增強自身的免疫力。
口腔潰瘍治療原則是消除致病誘因，增進機體健康，減輕局部癥狀，促進潰瘍愈合，但是目前還沒有特效藥物，所以治療時應針對每個病例的致病誘因和對藥物的反應，有側重地采用治療方法和藥物。平常注意休息，避免進食酸辣刺激食物，以減少復發次數。
口腔潰瘍的治療，主要是去除病因、增強體質、對癥治療。首先應該去除口腔內的不良刺激因素，比如殘冠、殘根、不良修復體、不良正畸等，同時戒煙限酒，不要吃辛辣刺激性的食物。其次多吃水果、蔬菜，多吃高蛋白的食物，補充機體所需要的營養及維生素。可以采取局部藥物治療的方法：主要目的是消炎、止痛，促進潰瘍愈合。
口腔潰瘍多般是由于上火、炎癥、感染和免疫力低下以及缺乏維生素等原因造成的。對于其初期的治療可以用口含片或者是噴劑進行治療，另外要注意口腔衛生和飲食清淡，此外還可以適當補充b族維生素并多喝水。