一般情況下，艾灸肛門對直腸炎的治療，能達到輔助治療的效果。
直腸炎多由腸道內菌群失調、有害菌滋生引起，而艾炙通常無殺菌、消炎之功效，故艾灸無法直接用于直腸炎，只能起到輔助治療的作用。直腸炎以藥物治療為主，在平時要注意生活作息規律，盡量不吃辛辣刺激性食物，不要濫用抗生素，以免對腸道正常菌群造成損害，這樣才能控制直腸炎病情。
直腸炎的治療有灌腸，對于糞便硬塊嵌頓導致的直腸炎應采取灌腸，解除糞便壓迫。由于引發直腸炎的病因較復雜，治療原則應根據引發直腸炎的病因及疾病采取相應的治療措施。可以通過糞便、涂片或活檢組織進行細菌、真菌和病毒檢測；相關抗體及毒素測定。要注意休息和飲食。
直腸炎栓是可以治療直腸炎的，栓劑作用比較直接效果也是比較好的，平時也可以去附近醫院中醫科診脈，看看舌苔，辯證調理中藥湯劑灌腸治療等，平時需要，消除各種可能致病的因素，如避免進食對胃黏膜有強刺激的飲食及藥品，避免辛辣刺激食物，避免油膩的食物，戒煙忌酒。注意飲食衛生，防止暴飲暴食。
直腸炎栓是可以治療直腸炎的，栓劑作用比較直接效果也是比較好的，平時也可以去附近醫院中醫科診脈，看看舌苔，辯證調理中藥湯劑灌腸治療等，平時需要，消除各種可能致病的因素，如避免進食對胃黏膜有強刺激的飲食及藥品，避免辛辣刺激食物，避免油膩的食物，戒煙忌酒。注意飲食衛生，防止暴飲暴食。
直腸炎治療一般要一周到半個月。但是這種疾病容易復發，稍有不注意飲食，就會前功盡廢。很多病人就是這樣反反復復的。所以，注意飲食尤為重要，合理膳食，適量運動，戒煙限酒，心理平衡，還有防止受涼，按時作息都是需要遵守的。