肛瘺的術后一般需要住院10-15天左右，在住院期間大夫會給輸預防感染、止疼、止血的藥物，每天會清洗傷口、換藥，一般術后15天左右沒有明顯的疼痛，這時候基本上就不影響正常的生活。根據創面的大小一般在40-45天左右的時間切口可以愈合，這時候肛瘺就可以完全治愈。
治療肛瘺需要通過肛瘺切開掛線術，手術過程一般是在保護肛門括約肌功能的前提下盡量將瘺管壁以及內口外口處理干凈。手術中肛門局部形成皮筋的掛線，術后隨著皮筋的脫落，表明局部括約肌間斷性的切割。皮筋脫落以后表明局部傷口基本恢復，還需要后期生長肉芽。
首先一定要多注意休息，避免過度勞累，盡量多臥床休息，定期的到醫院復診復查，給予相應的處置。同時一定要注意自己的飲食，不要吃辛辣刺激的食物，不要吃油膩大的食物，多吃青菜水果類食物，一定要保證大便通暢，每日藥物坐浴。
肛瘺是常見病，臨床可表現為肛旁有一硬結，伴反復膿性分泌物，肛門疼痛等癥狀。治療宜行手術治療。術后堅持每日換藥治療，直至傷口完全好。傷口好的時間要根據傷口情況。建議傷口恢復后再考慮正常上班。忌辛辣，忌酒，保持心平氣和。
肛瘺多為化膿性感染所致，少數為特異性感染，如結核、克羅恩病、潰瘍性結腸炎等感染亦可所致。最佳治療辦法可以手術處理。通常術后需要半月到一月時間恢復，手術觀察期間一定要注意飲食生活作息，少吃辛辣刺激的食物，少喝酒，多注意局部的衛生清洗，勤換內褲。