首先一定要多注意休息，避免過度勞累，盡量多臥床休息，定期的到醫院復診復查，給予相應的處置。同時一定要注意自己的飲食，不要吃辛辣刺激的食物，不要吃油膩大的食物，多吃青菜水果類食物，一定要保證大便通暢，每日藥物坐浴。
肛瘺手術一般愈合周期需要一個月，一周左右就可以正常工作，需要每天大便后溫開水坐浴，保持傷口清潔，每天換藥一次就可以了。忌辛辣，忌酒，保持心平氣和，要生活規律，清淡飲食，多吃蔬菜和水果。
肛瘺的根治術指的是找到肛瘺的內口，將瘺管全部切開，根據瘺管與肛門括約肌的關系，肛瘺可以分為高位肛瘺和低位肛瘺兩種，如果是高位肛瘺，一般主張采取肛瘺掛線療法，而低位肛瘺可以采取瘺管切除手術。清淡飲食避免油膩或刺激性的食物，粗纖維飲食預防大便干結；定期排便術后正常進食，養成正常排便習慣預防大便干結。
肛瘺最主要的治療辦法是進行手術，由于屬于一種慢性感染性疾病，治療周期比較長，很容易出現復發，通常是由于急性肛周膿腫，沒有得到及時或者有效的治療轉變而來的，也有一些是患有腸道的慢性炎癥性疾病，出現了肛周的反復的瘺口，手術以后，換藥也非常關鍵，注意局部衛生，堅持坐浴。
肛周膿腫治療手術，通場是不會形成肛瘺，病人應創面慢慢恢復。應該注意清淡飲食，禁食辛辣刺激性食物，保持大便通暢及肛周清潔，便后可用花椒水清洗肛周，避免久蹲，定期換藥。