肛瘺最主要的治療辦法是進行手術(shù)，由于屬于一種慢性感染性疾病，治療周期比較長，很容易出現(xiàn)復(fù)發(fā)，通常是由于急性肛周膿腫，沒有得到及時或者有效的治療轉(zhuǎn)變而來的，也有一些是患有腸道的慢性炎癥性疾病，出現(xiàn)了肛周的反復(fù)的瘺口，手術(shù)以后，換藥也非常關(guān)鍵，注意局部衛(wèi)生，堅持坐浴。
首先一定要多注意休息，避免過度勞累，盡量多臥床休息，定期的到醫(yī)院復(fù)診復(fù)查，給予相應(yīng)的處置。同時一定要注意自己的飲食，不要吃辛辣刺激的食物，不要吃油膩大的食物，多吃青菜水果類食物，一定要保證大便通暢，每日藥物坐浴。
肛瘺的根治術(shù)指的是找到肛瘺的內(nèi)口，將瘺管全部切開，根據(jù)瘺管與肛門括約肌的關(guān)系，肛瘺可以分為高位肛瘺和低位肛瘺兩種，如果是高位肛瘺，一般主張采取肛瘺掛線療法，而低位肛瘺可以采取瘺管切除手術(shù)。清淡飲食避免油膩或刺激性的食物，粗纖維飲食預(yù)防大便干結(jié)；定期排便術(shù)后正常進食，養(yǎng)成正常排便習(xí)慣預(yù)防大便干結(jié)。
存在肛瘺這種疾病，盡快的早期手術(shù)。肛瘺可以大致分為兩種，一種是低位的簡單肛瘺，這種肛瘺可以通過手術(shù)直接把瘺道切開，然后處理內(nèi)口，傷口愈合徹底，這種病就可以徹底的治療好。
肛瘺一般需要手術(shù)治療，而且越早越好。不手術(shù)治療肛瘺一般需要手術(shù)治療。效果不穩(wěn)定，如過食辛辣厚味，或受涼拉肚子，或勞作太過等，局部的炎癥就可復(fù)發(fā)，感染化膿。當(dāng)閉合口較堅固時，可在原口處重新流膿，如此反復(fù)不愈。若閉合口道，如此反復(fù)，瘺管就會逐漸增多。