一般情況下，腦膜炎患者做穿刺時有一定的疼痛感。
腦膜炎穿刺指行腰椎穿刺術，需在病人腰椎第3-4或第4-5椎間隙入針穿刺蛛網膜下腔，測腦脊液壓力并保留腦脊液標準化驗。通常穿刺前會用利多卡因進行局部麻醉，因此病人通常僅有打麻藥的痛感，類似于通常皮試的痛感。穿刺時，可出現輕度脹痛感，如果醫生操作不但，傷及神經根時，可出現放電樣痛，但疼痛程度不重。

做不做穿刺，需要根據病情來決定。腦炎診斷的金標準就是腦脊液發現異常的情況的，腦炎的診斷主要是有上感的病史的，還有劇烈頭痛，發熱，惡心嘔吐，頸項強直，腦膜炎刺激征陽性的，有的還有腦電地形圖及頭顱核磁共振異常的情況。

腦炎也分很多種，每種腦炎以及嚴重程度都不一樣，腦炎是有存在后遺癥的可能，不管是智力還是各種其他方面，都有可能出現問題，既往孩子比較小，可能各種方面表現都不明顯，隨著年齡的增大逐漸出現。孩子是否存在智力低下其實很好明確，可以去心理科做一個智力篩查，就可以知道孩子智力情況。

如果說腦膜炎特別的嚴重的話，是會對智力有影響的，腦膜炎的話是一種對生命有危險的疾病，建議一定要及時的治療，大概的話是需要兩個星期左右的時間的，雖然說腦膜炎是一種很嚴重的疾病，但是的話大多數人都是能夠完全的恢復的，只有少數的人才會留下后遺癥。

細菌性腦膜炎是一種危及生命的疾病，應立即治療。一旦出現癥狀，應立即進行緊急治療。對于常規治療，如果發生腦膜炎，應該去醫院直到感染完全消除，這需要大約兩周的時間。如果患者感染了細菌性腦膜炎，患者將使用大劑量的抗生素，可能是靜脈注射。抗生素被廣泛用于治療細菌性腦膜炎。

兒童病毒性腦膜炎穿刺一般不能確診。
病毒性腦膜炎是由于感染了腦膜而導致的一種發炎。一些身體會出現特異的病毒，可以用腰椎穿刺的腦脊液來確診。不過，病毒性腦脊液的預后還可以，但也是有自限性的，一般都是在身體出現特效性的病毒抗體之前就已經痊愈，不需要再進行穿刺檢查。因此，如果不能及時的進行腰椎穿刺，或者是排除其他腦膜炎的可能性。