對于女性生殖系統的霉菌感染，可以通過藥物來進行治療，不管是局部用藥還是全身用藥，都要看病情的嚴重程度。
如果生殖器炎是由霉菌引起的，可以通過外用抗菌藥物進行治療，在有性行為的患者最好是使用陰道用藥，在治療過程中要盡量不要發生性關系，防止發生交叉感染。

耳朵內有霉菌感染時，會感到奇癢難耐。在治療的時候患者要注意保持耳朵的干凈，避免潮濕，可以在耳朵里面滴入硼酸溶液，這樣可以起到收斂和抑制滲出的效果。可以外用復方酮康唑乳膏，具有抗真菌的功效。
建議患者不能頻繁的摳耳朵，也不能進行摘耳手術，以免造成交叉感染。不能隨便買滴耳液，否則會影響到外耳道的正常細菌環境。真菌性外耳道炎首先要確定自身的免疫系統疾病和糖尿病，要及時治療才能緩解。

一般情況下，臉部真菌感染的治療方法有以下幾方面：
患者可以先口服伊曲康唑膠囊，但需遵醫囑，用藥前輔查肝功、血脂等，也可口服鹽酸莫西沙星片、復方甘草酸苷片等，再用復方黃柏洗劑、晟露洗劑等冷濕敷貼，也可以用鹽酸布替萘芬搽劑、鹽酸特比萘芬乳膏等交替早、晚外涂。如感染較重，需預先進行皮膚無菌清創，再用碘化鉀溶液、硝酸咪康唑軟膏等交替早外涂，平時應忌辛辣、忌飲酒等。

皮下真菌病和全身性真菌病統稱為深層真菌病。我國深部真菌病的發生率急劇上升，這與廣譜抗生素、類固醇、免疫抑制劑、器官移植、導管手術、糖尿病、愛滋病等因素有關。可通過如下方式治療：
1.臨床上以念珠菌、隱球菌、曲霉菌等最多，治療深部真菌性疾病首先要消除各種誘發因素；
2.其次要根據患者的具體情況選擇不同的抗菌藥物：兩性霉素B是目前常用的治療藥物。
3.氟胞嘧啶、制霉菌素；咪康唑、酮康唑、克霉唑、氟康唑、伊曲康唑等藥物都可用于治療該疾病。

生殖部位真菌感染可以通過生活護理、藥物治療等方式改善。
1、生活護理：日常的時候要注意個人清潔，經常更換內衣，日曬雨淋等，能有效的殺死細菌。
2、藥物治療：使用小蘇打水沖洗，可以去除白斑和絲狀的分泌物，清潔后要注意保持干燥。若確診為霉菌，可選用抗菌藥，如酮康唑，或陰道栓劑。病情較重的患者可以選擇服用伊曲康唑膠囊。

男性出現生殖真菌感染，建議先到皮膚科就診，通過真菌檢查明確診斷，再通過藥物和日常防范等方法進行治療。
治療的常用藥物有伊曲康唑膠囊、復方酮康唑乳膏等藥物搭配治療，患者在日常生活中要注意私處的衛生，勤換內褲。包皮過長的患者，建議做包皮的環切術來防止復發，此外，性伴侶需要供同治療。