頭部真菌感染后會出現三種皮膚病，主要指白癬、黑癬和黃癬，本身都是真菌作用于局部頭皮后導致的皮膚病。白癬主要表現為白色斑塊、脫皮，有輕微的斷發，黑癬主要稱黑色片狀皮損，可導致頭發從發根剝脫，黃癬呈黃色皮損會呈現永久性脫發。絕大多數頭部真菌感染會伴隨明顯的頭皮、瘙癢和局限部位的脫皮，如果要治療建議選擇口服藥物配合外用藥物進行治療。

通常，對于真菌感染的治療，可以選擇刮掉頭發，否則癥狀容易反復出現，可以選擇口服藥物或與一些軟膏和其他治療方法一起使用。頭皮真菌感染也可以治療。病人可以用中藥治療來提高免疫力。

注意頭部衛生，適當把頭發剪短，必要的話，可以考慮剃光頭不過作為女性一般剪短就行了，否則影響美觀，這樣更方便外用藥吸收。在指導下外用一些抗真菌的制劑，還有就是短期內服用抗真菌藥物。

一般情況下，臉部真菌感染的治療方法有以下幾方面：
患者可以先口服伊曲康唑膠囊，但需遵醫囑，用藥前輔查肝功、血脂等，也可口服鹽酸莫西沙星片、復方甘草酸苷片等，再用復方黃柏洗劑、晟露洗劑等冷濕敷貼，也可以用鹽酸布替萘芬搽劑、鹽酸特比萘芬乳膏等交替早、晚外涂。如感染較重，需預先進行皮膚無菌清創，再用碘化鉀溶液、硝酸咪康唑軟膏等交替早外涂，平時應忌辛辣、忌飲酒等。

皮下真菌病和全身性真菌病統稱為深層真菌病。我國深部真菌病的發生率急劇上升，這與廣譜抗生素、類固醇、免疫抑制劑、器官移植、導管手術、糖尿病、愛滋病等因素有關。可通過如下方式治療：
1.臨床上以念珠菌、隱球菌、曲霉菌等最多，治療深部真菌性疾病首先要消除各種誘發因素；
2.其次要根據患者的具體情況選擇不同的抗菌藥物：兩性霉素B是目前常用的治療藥物。
3.氟胞嘧啶、制霉菌素；咪康唑、酮康唑、克霉唑、氟康唑、伊曲康唑等藥物都可用于治療該疾病。

耳朵內有霉菌感染時，會感到奇癢難耐。在治療的時候患者要注意保持耳朵的干凈，避免潮濕，可以在耳朵里面滴入硼酸溶液，這樣可以起到收斂和抑制滲出的效果。可以外用復方酮康唑乳膏，具有抗真菌的功效。
建議患者不能頻繁的摳耳朵，也不能進行摘耳手術，以免造成交叉感染。不能隨便買滴耳液，否則會影響到外耳道的正常細菌環境。真菌性外耳道炎首先要確定自身的免疫系統疾病和糖尿病，要及時治療才能緩解。