卵巢巧克力囊腫的危害有：引起月經不調、腹痛、性生活痛等不適癥狀；造成盆腔器官的粘連；導致彌漫性腹膜炎；引起輸卵管阻塞，導致不孕。反胃、嘔吐、發燒和腹部劇痛。需要去正規醫院專科治療的。

卵巢巧克力囊腫又名卵巢子宮內膜異位囊腫，是子宮內膜異位癥的一種病變。其癥狀主要是痛經進行性加重、性交疼痛、不孕及月經失調，如要治療還用手術治療。日常避免高度緊張及精神刺激，要保持樂觀情緒以及充足的睡眠，保證良好的生活習慣；平時飲食要清淡有營養，糾正偏食及不正常的飲食習慣，不宜常食刺激性食物、海產品等。

巧克力囊腫不嚴重是可以治療好的，可以采用中藥治療并定期隨訪檢查，中藥通過活躍肝脾之臟腑，可以達到調節氣血平衡、全面調理內分泌系統進而治療巧克力囊腫的目的，但是也可以選擇其他治療方法，比如保守性手術、激素療法等。

巧克力囊腫的早期癥狀是痛經，且呈進行性加重，有的也可沒有癥狀，是由于不孕癥，去醫院檢查時才發現的。巧克力囊腫的癥狀主要是月經量多、痛經、腹部包塊，尤其是會出現性前時疼痛出血。

巧克力囊腫的護理要保證充分的睡眠：每天早起早睡，可以使皮膚變得更好，而且卵巢也會更健康。還可以適量喝些紅酒：紅酒可以促進卵巢活性，從而提高卵子的質量。多吃一些一些豆腐豆漿及豆制品，因為里面含有大量的植物蛋白，可以讓卵巢更結實，卵子更健康。

生理性囊腫不需要手術，病理性囊腫通常需要手術來確認診斷并相應地治療。去正規醫院檢查做B超。彩色B超，X線檢查，腹腔鏡檢查等先進的診斷技術可用于卵巢囊腫的早期診斷。雖然卵巢囊腫易于惡變，但只要早期發現，早期發現和早期治療都可以避免。