乙肝大三陽與小三陽之間存在差異，大三陽表明病毒復制較活躍，傳染性相對較強。
小三陽一般提示病情處于慢性化，傳染性較弱。當然，對乙肝患者來說，也以大三陽或小三陽為準，及乙肝DNA和其他有關數值，對疾病進行全面的分析和判斷，及抗病毒治療方案的指導。臨床上主要使用的是拉米夫定聯合利巴韋林進行抗病毒治療。當前乙肝患者在接受了正規抗病毒治療后，病情很平穩，而抗病毒治療則需長期服藥，現在口服藥物治療時間至少為4年，部分病人需終身服藥。

乙肝小三陽是指乙肝表面抗原陽性，e抗體陽性，核心抗體等陽性，即小三陽。而表面抗原陽性，e抗原陽性，核心抗體陽性，則稱為大三陽。
大三陽的病毒載量比較大，有八次方甚至十次方，小三陽病毒的載量一般都比較低，比大三陽病毒要低一些，傳染性也比較弱。不同的是，不管是小三陽還是小三陽，都要定期監測肝功能，一旦發現肝功能出現問題，要及時治療，避免出現肝炎反復發作、肝硬化、癌變等不良反應。

乙肝小三陽和大三陽的區別通常在于指標、治療方案等方面。
乙肝小三陽與乙肝大三陽是不一樣的，乙肝小三陽是指乙肝表面抗原、乙肝e抗體、乙肝核心抗體三個指標呈陽性，而乙肝大三陽則是指乙肝表面抗原、乙肝e抗原、乙肝核心抗體為陽性。乙肝小三陽患者只要肝功能正常，一般不需要進行任何的治療，只需定期復查即可。而乙肝大三陽患者通常需要進行系統干預，以免肝功能嚴重受損。

在乙肝兩對半化驗單中，乙肝小三陽是145陽性，乙肝大三陽是135陽性。乙肝大三陽提示乙肝病毒數量多，病毒復制活躍，傳染性大。乙肝小三陽提示乙肝病毒數量相對較少，病毒復制活躍稱程度低，傳染性小。所以乙肝大三陽比乙肝小三陽要嚴重些。但是針對乙肝大三陽患者也不要擔心，目前有恩替卡韋、替諾福韋酯等抗病毒藥物，90%能使大三陽轉變為小三陽的。

乙肝大三陽和小三陽的區別在于大三陽是e抗原陽性，小三陽是e抗原陰性。
乙肝大三陽指乙肝患者體內乙肝病毒的免疫指標即乙肝表面抗原、乙肝e抗原、乙肝核心抗體這三項為陽性，指標可提示患者體內病毒的復制是否比較活躍，但卻法知曉該細胞是否受到嚴重損害。患者在去醫院進行檢測時，如果表面抗原乙肝e抗原和核心抗體的檢測都是陽性，也就是乙肝五項檢測中135呈陽性，則是大三陽。如果乙肝五項檢測中，145都是陽性，我們則可以稱其為小三陽。大三陽體內的乙肝病毒會呈現較活躍的復制狀態傳染性也是比較長，小三陽的肝功能長期較正常，稱為穩定性的小三陽，傳染性較低。肝功能檢查時發現反復異常，則為不穩定性的小三陽，傳染性較強。

乙肝大三陽和小三陽都是針對乙肝五項來說的，乙肝五項包括乙肝表面抗原、乙肝表面抗體、乙肝e抗原、乙肝e抗體和乙肝核心抗體五項。大三陽是指以上順序中的第135項陽性，小三陽指第145項是陽性的。常規的大三陽提示病毒復制活躍，而小三陽提示乙肝病毒處于相對穩定的狀態，但是并不能一概而論，有的乙肝五項呈現的小三陽。