由于胎兒大腦發育所需的甲狀腺激素主要來自母親，孕婦甲狀腺功能減退會影響胎兒神經系統的正常發育，導致胎兒智力發育障礙和出生智力低下，尤其是妊娠期間對胎兒神經系統發育是有影響的。

妊娠期間甲狀腺功能減退對胎兒的影響與甲狀腺功能減退的程度有關，臨床性甲減會對胎兒發育造成一定的影響，從而造成胎兒生長發育滯后，甚至有可能造成流產的危險。
亞臨床甲減會不會引起妊娠期并發癥，目前尚有爭論，但如果懷孕初期出現甲減，特別是臨床性甲減，會對胎兒的長期智力產生一定的影響，總之，妊娠期甲減對胎兒的影響，與孕婦甲減的情況有很大關系。

妊娠期臨床甲減可增加妊娠不良結局發生的機會，并可對胎兒神經智力發育產生不利影響。
妊娠不良結局有早產，低體重兒，流產。妊娠期臨床甲減流產風險將上升60%以上，妊娠期高血壓風險上升30%以上，臨床甲減孕婦死胎風險將上升。未處理臨床甲減孕婦胎兒死亡、流產、循環系統畸形和低體重兒發生率可明顯增加。臨床甲減患者在妊娠期得到有效治療后，可極大地減少以上情況發生。
臨床甲減的孕婦在打算懷孕時需經過正規的左旋甲狀腺激素替代治療才能使甲狀腺激素的含量恢復到正常水平。

妊娠期間甲減對孕婦的作用與甲減的嚴重程度有關，遺傳的甲減會對胎兒的發育造成一定的不良反應，從而造成胎兒的生長發育滯后，甚至有可能造成流產的危險。
亞臨床甲減是不是引起懷孕的原因，目前還沒有定論，但在懷孕初期出現甲減，特別是臨床性甲減，會對胎兒的長期智能產生一定的負面作用。總之，妊娠期間甲減對胎兒的影響，與懷孕期間的甲減有很大關系。

孕期甲狀腺功能減退，對胎兒的生長發育、智力，皮膚等都有影響，增加流產率、早產率、胎兒死亡率，導致胎兒智力發育受損，增加胎兒出生缺陷，甚至出現呆小癥。表現為智力發育異常、面部表情呆滯、鼻梁扁塌、四肢粗短。

孕婦甲狀腺功能減退時，可使胎兒中樞神經系統發育障礙，造成智力下降、畸形或早產。因此，為了避免這些不良情況發生，應該加強對甲狀腺疾病的重視程度，積極做好相關預防工作。備孕時懷孕時均需要甲狀腺功能檢查，有甲狀腺功能減退者一旦發生，那就應該及時補充甲狀腺激素了，使甲狀腺功能處于正常的偏上狀態，不與藥物一味抵觸，以免延誤治療，影響胎兒發育。