有的心房顫動能根治，如孤立性房顫、陣發性心房顫動等，對此種情況可先考慮轉復，轉成竇性心律后，若日后不再發作，則算根治。
如轉復失敗，亦可行射頻消融術（RFA）.射頻消融術成功率可達甚至更高，獲得成功后亦等于痊愈，但對持續性心房顫動（房顫），和永久性心房顫動（房顫），則難以根治，通常僅采用控制心室率和抗凝等方法。

持續性房顫的治療涉及到其病因的治療。與甲狀腺功能亢進一樣，甲狀腺功能亢進可引起持續性房顫，因此治療甲狀腺功能亢進有助于持續性房顫的治療。控制心室率，重建竇性心率，預防栓塞。由于地高辛能增加房室傳導的延遲和阻滯，故通常可通過地高辛控制心室率。例如，獨自地高辛不夠有效。維拉帕米(維必定)最有效。

心房顫動能否治愈要看心房顫動的種類，如果是一個首發的心房顫動，時間沒有超過48小時，首先就要考慮轉復房顫，可以采用電復律也可以采用藥物來轉復，一旦轉復成功也算治愈。如果心房顫動的時間比較長，再是一個陣發房顫超過48個小時，就可以考慮轉復，前提就是要充分的抗凝。

在一部分人當中房顫是可以治好的，房顫的導管射頻消融手術，或者是外科的迷宮術，是對房顫從電生理機制上進行的一種干預治療，能夠在一定程度上達到長期維持正常的竇性心率的效果。當然不是所有的人都能夠通過這兩種手術達到治好的效果的。對于一些沒有器質性心臟病的人，特別是特發性房顫的人，通過導管射頻消融手術或者是外科的迷宮手術，能夠達到長時間的維持竇性心律，這些人的效果是比較好的。

48小時內心房顫動可以直接復率，否則需要前三后四周的抗凝治療，房顫治療主要是控制心室率，復率，預防并發癥三種，房顫發病和高血壓，冠心病，瓣膜病，甲亢有關系。可以到心內科診治，注意休息勞逸結合，避免焦慮，戒煙酒，避免刺激性食物。

心房顫動治療強調長期綜合管理，即在治療原發疾病和誘發因素的基礎上，積極預防血栓栓塞、轉復并維持竇性心律及控制心室率，醫生會根據病因、臨床癥狀不同等給予藥物、手術或者射頻消融治療等不同的治療方案。
對于已不適合藥物轉復或藥物及電復律轉復失敗的老年患者，治療目的則是控制心室率。目前常用藥物有洋地黃、β受體阻斷藥、鈣通道阻斷藥、胺碘酮等。中醫藥對房顫的主要干預手段有藥物治療、針灸療法等，例如參附注射液，溫補心陽，安神定悸。用于心陽不振所造成的心慌不安、胸悶氣短。