小兒腦膜炎應該做以下檢查。
脊液檢查─化學檢查─蛋白質檢查，腦嵴液病原體檢查（CSF），腦脊液細菌培養等，腦脊液的一般性狀檢查，聚合酶鏈反應技術、血常規、胸部平片、胸部MRI等。在臨床上常見到腦嵴髓膜炎癥和顱內感染等癥狀相似者，容易混淆，造成誤診。確診腦炎，用特異性抗體檢驗或者病毒分離，可以進一步闡明病原。
腦膜炎可以通過穿刺、磁共振等檢查明確具體情況。
在確診腦膜炎時，要根據病人有沒有頭痛、惡心、嘔吐、頸部肌肉麻木、抽搐、譫妄等神經系統的表現明確具體情況。如果有以上的表現，可以進行穿刺檢查，確定腦脊液的性質和病因。如果是腦膜炎，可以通過磁共振來檢測，但是很難對其進行明確的分類，因為只是因為腦膜炎癥的變化而導致的，如果是輕微的腦膜炎，可以通過藥物來緩解，如果病情加重，會危及到病人的性命。
腦膜炎的診斷要綜合考慮患者的癥狀、體征、頭顱CT、血常規、腦脊液的常規檢查、腦脊液的免疫檢查等。
腦膜炎的病人有可能會有頭疼、惡心、嘔吐、頸部僵硬等表現。如果頭部CT顯示有腦水腫，沒有其他的癥狀，腦脊液細胞學和病原學檢查有致病微生物，可以診斷為腦膜炎。腦膜炎一旦確診，應積極使用敏感的抗生素進行抗感染治療，并要注意減少顱內壓、改善腦代謝、緩解腦水腫等。
臨床上，如果是急性腦膜炎，首先要做常規檢查，比如血液分析、c反應蛋白、紅細胞沉降率、降鈣素原、病毒篩查、肝腎功能等。
同時還要抽取腦脊液進行化驗，看看是病毒性腦膜炎還是細菌性腦膜炎、隱球菌腦膜炎。還需要做頭顱磁共振檢查，看看是腦膜炎還是腦膜腦炎。如果患者還有癲癇，需要做腦電圖檢查，排除腦膜炎等繼發性癲癇的可能。
CT、MRI檢查。病變早期CT或顱腦MRI檢查可正常。有神經系統并發癥時可見腦室擴大、腦溝變窄、腦腫脹、腦移位等異常表現。并可發現室管膜炎、硬膜下積液及局限性腦膿腫。增強MRI掃描對診斷腦膜炎比增強CT掃描敏感增強。